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返回 基因大数据+云计算,推动精准医疗跨越式发展

2021-01-12

近年来,随着医疗科技的发展,人们对于健康的重视使得精准医疗的发展进入快车道。其中,基因测序作为一项高效的医疗辅助手段,逐步应用于临床实践中。基因测序解决方案融合云计算和大数据的能力及优势,针对海量的基因组数据进行计算、存储和分析,用于疾病的预防、疾病的诊断、指导个体化用药,还能够帮助病毒基因研究所研发病毒诊断试剂,监控疫情。

云计算和基因测序有什么关系?

随着互联网的普及、实验技术的不断创新,研究规模和数据量急剧扩增,生物的DNA、基因序列、生物芯片等无时无刻不产生海量数据。生命科学的数据来源和形式多样,包括基因测序、分子通道、不同种族的人群等。每个临床试验需要成千上万病患长达数年的统计资料,而DNA测序的每个样本产生的数据都能以兆兆位计算。

如果能高效地利用这些大数据,无疑将为生命科学领域带来无限机遇,而云计算便能很好的解决这些问题。当普通实验室计算能力已不足以应付日益庞大的数据分析时,云计算的诞生不单将有助于解决数据瓶颈问题,更为未来的实验室数据分析提出了新的方向。

目前,基因测序在持续发展落地的过程中存在以下4个方面的痛点:

1. 峰谷分配不均,需弹性缩扩资源:测序业务一般为项目型,存在峰谷之分,峰值资源需求较大,本地资源不足以支持,低谷时资源闲置浪费,需可伸缩的IT资源。

2. 三代测序发展,算力要求高:新兴的三代测序借助读长优势,可以很好的覆盖二代测序的不足,已成为重要技术趋势,传统基础架构已经无法满足其对算力方面的更高要求。

3. 系统环境复杂,运维难度高:基因测序行业PB级别数据存储包含规划、分配、回收、归档等过程,这些过程对数据管理员要求非常高,造成运维成本高。

4. 基因数据的安全性要求高:基因测序行业掌管着大量客户的隐私数据,甚至涉及到国家生物基因安全,数据安全保护重要性不言而喻。

在基因行业,有孚专有云充分发挥了多年来在高性能计算、海量存储、数据安全方面等优势,为基因行业客户提供了高度整合多种功能的基因行业专有云解决方案。

计算能力方面:为解决基因行业在计算力方面的痛点,依托于自建的数据中心,有孚专有云能够提供比传统架构提高数十倍计算性能。同时结合有孚AI和大数据应用,全面支持多种GPU应用程序、深度学习框架。既能实现较高的计算处理性能,又在能效比、内存支持,以及CPU本身的架构上具有很大的优势,满足基因行业对计算能力的要求。

海量存储方面:海量存储系统是基因研究的必备条件。基因数据大多以非结构化形式存在,并需要妥善保存以做后续利用。有孚专有云对象存储服务能够实现基因数据存储空间无上限,能够根据需求弹性伸缩,提高业务灵活性。

数据安全方面:企业自建的数据中心一旦被攻击,很容易导致数据的泄露和丢失,给企业和个人都带来严重的影响。利用有孚专有云基因解决方案,能够为企业提供专业的数据保护方案,同时支持HTTPS/SSL安全协议,支持数据加密上传,多种方式和技术确保数据传输与访问的安全,为基因测序行业提供出色的安全服务。

成本方面:成本一直是制约基因行业走向普及化的重要因素。有孚专有云解决方案支持热存储数据自动沉降至冷存储,通过数据存储分层方式,降低总体存储成本。对项目支出、资源负载提供可视报表、实时资源监控图和项目资源清单,辅助用户多维度分析、审计和优化资源使用现状,提升资源的利用效率。

随着基因行业的快速发展,人们对于自身健康的关注已经从被动的病后治疗变为主动防治,也实实在在感受到科技助力医疗带来的福利。在有孚专有云基因行业解决方案强有力支持下,基因测序行业将迎来新的发展。